A hörcsögöknél sajnos gyakran előfordul, hogy megeszik kicsinyeiket, különösen az első alomnál. Általában az egészen fiatal, 1-2 napos kölykök esnek áldozatul. A kannibalizmus hátterében tápanyaghiány vagy az állatok zavarása állhat, ilyenkor az anya nem érzi magát biztonságban. Az Ön által leírt esetben azt hiszem, tápanyaghiányról nem beszélhetünk, de az előfordulhat, hogy a szülői feladatokban még járatlan anya a napi takarítást is zavarásnak vette. Ilyenkor a stressz miatt az anya elapaszt, tej nélkül a kicsik elpusztulnak. Nagyon valószínű, hogy a kicsik (mivel már 5 naposak voltak) előbb elpusztultak, mint az anyjuk megrágta őket.
Azt tanácsolom, a maradék két kicsit a lehető legnagyobb nyugalomban hagyja felnevelni, a következő alomnál valószínűleg az anya nagyobb tapasztalattal rendelkezik majd, és a kicsik gond nélkül felnőnek.